Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ABCC1P33527 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms