Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHRNA3P32297 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHRNA3P32297 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHRNA3P32297 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CHRNA3P32297 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms