Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms