Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA13P31271 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.4 ms