Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HOXA9P31269 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms