Protein–RNA interactions for Protein: P30304

CDC25A, M-phase inducer phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC25AP30304 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC25AP30304 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC25AP30304 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC25AP30304 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC25AP30304 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC25AP30304 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC25AP30304 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC25AP30304 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC25AP30304 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC25AP30304 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC25AP30304 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC25AP30304 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC25AP30304 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC25AP30304 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC25AP30304 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC25AP30304 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC25AP30304 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC25AP30304 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC25AP30304 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC25AP30304 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC25AP30304 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDC25AP30304 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC25AP30304 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms