Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCND3P30281 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCND3P30281 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCND3P30281 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCND3P30281 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCND3P30281 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCND3P30281 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCND3P30281 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCND3P30281 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCND3P30281 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCND3P30281 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCND3P30281 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCND3P30281 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCND3P30281 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCND3P30281 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCND3P30281 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCND3P30281 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCND3P30281 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCND3P30281 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCND3P30281 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCND3P30281 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCND3P30281 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCND3P30281 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCND3P30281 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCND3P30281 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCND3P30281 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCND3P30281 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCND3P30281 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCND3P30281 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCND3P30281 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCND3P30281 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCND3P30281 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCND3P30281 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCND3P30281 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCND3P30281 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCND3P30281 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCND3P30281 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCND3P30281 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCND3P30281 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCND3P30281 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCND3P30281 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCND3P30281 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCND3P30281 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCND3P30281 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCND3P30281 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCND3P30281 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCND3P30281 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCND3P30281 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCND3P30281 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCND3P30281 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCND3P30281 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCND3P30281 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCND3P30281 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCND3P30281 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCND3P30281 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCND3P30281 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCND3P30281 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCND3P30281 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCND3P30281 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCND3P30281 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCND3P30281 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCND3P30281 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCND3P30281 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCND3P30281 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCND3P30281 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCND3P30281 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCND3P30281 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCND3P30281 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCND3P30281 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCND3P30281 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCND3P30281 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCND3P30281 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCND3P30281 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCND3P30281 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCND3P30281 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCND3P30281 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCND3P30281 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCND3P30281 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CCND3P30281 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCND3P30281 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCND3P30281 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCND3P30281 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCND3P30281 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCND3P30281 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCND3P30281 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCND3P30281 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCND3P30281 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCND3P30281 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCND3P30281 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCND3P30281 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCND3P30281 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCND3P30281 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCND3P30281 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCND3P30281 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCND3P30281 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCND3P30281 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCND3P30281 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCND3P30281 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCND3P30281 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCND3P30281 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms