Protein–RNA interactions for Protein: P30279

CCND2, G1/S-specific cyclin-D2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND2P30279 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCND2P30279 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCND2P30279 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCND2P30279 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCND2P30279 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCND2P30279 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCND2P30279 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCND2P30279 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCND2P30279 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCND2P30279 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCND2P30279 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCND2P30279 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCND2P30279 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCND2P30279 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCND2P30279 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCND2P30279 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCND2P30279 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCND2P30279 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCND2P30279 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCND2P30279 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND2P30279 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND2P30279 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND2P30279 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND2P30279 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND2P30279 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND2P30279 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND2P30279 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND2P30279 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND2P30279 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND2P30279 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND2P30279 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND2P30279 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND2P30279 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND2P30279 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND2P30279 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND2P30279 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND2P30279 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND2P30279 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND2P30279 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND2P30279 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND2P30279 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND2P30279 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND2P30279 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND2P30279 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCND2P30279 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCND2P30279 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCND2P30279 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCND2P30279 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCND2P30279 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCND2P30279 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCND2P30279 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCND2P30279 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCND2P30279 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCND2P30279 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCND2P30279 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCND2P30279 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCND2P30279 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCND2P30279 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCND2P30279 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND2P30279 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND2P30279 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND2P30279 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND2P30279 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND2P30279 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND2P30279 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND2P30279 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND2P30279 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND2P30279 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND2P30279 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND2P30279 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND2P30279 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND2P30279 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND2P30279 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND2P30279 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND2P30279 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND2P30279 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND2P30279 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCND2P30279 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCND2P30279 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCND2P30279 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCND2P30279 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCND2P30279 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCND2P30279 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCND2P30279 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCND2P30279 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCND2P30279 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCND2P30279 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCND2P30279 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCND2P30279 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCND2P30279 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCND2P30279 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCND2P30279 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCND2P30279 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCND2P30279 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCND2P30279 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCND2P30279 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCND2P30279 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCND2P30279 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCND2P30279 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCND2P30279 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms