Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms