Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms