Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE4AP27815 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE4AP27815 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE4AP27815 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE4AP27815 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PDE4AP27815 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE4AP27815 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE4AP27815 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE4AP27815 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE4AP27815 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE4AP27815 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE4AP27815 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE4AP27815 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms