Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGA3P26006 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGA3P26006 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGA3P26006 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGA3P26006 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGA3P26006 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGA3P26006 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGA3P26006 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGA3P26006 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGA3P26006 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGA3P26006 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGA3P26006 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGA3P26006 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGA3P26006 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGA3P26006 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA3P26006 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA3P26006 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA3P26006 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA3P26006 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA3P26006 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA3P26006 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA3P26006 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA3P26006 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA3P26006 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA3P26006 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA3P26006 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA3P26006 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA3P26006 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA3P26006 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITGA3P26006 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITGA3P26006 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITGA3P26006 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITGA3P26006 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITGA3P26006 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms