Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms