Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
PTPRGP23470 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms