Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms