Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms