Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCP2P22307 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCP2P22307 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCP2P22307 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCP2P22307 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCP2P22307 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCP2P22307 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCP2P22307 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCP2P22307 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCP2P22307 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCP2P22307 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCP2P22307 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCP2P22307 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCP2P22307 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCP2P22307 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCP2P22307 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCP2P22307 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCP2P22307 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCP2P22307 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCP2P22307 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SCP2P22307 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCP2P22307 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCP2P22307 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCP2P22307 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCP2P22307 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCP2P22307 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCP2P22307 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCP2P22307 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCP2P22307 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCP2P22307 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCP2P22307 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCP2P22307 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCP2P22307 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCP2P22307 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SCP2P22307 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCP2P22307 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCP2P22307 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCP2P22307 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCP2P22307 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCP2P22307 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCP2P22307 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SCP2P22307 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SCP2P22307 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SCP2P22307 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCP2P22307 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SCP2P22307 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCP2P22307 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCP2P22307 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCP2P22307 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCP2P22307 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCP2P22307 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCP2P22307 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCP2P22307 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCP2P22307 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCP2P22307 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCP2P22307 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCP2P22307 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCP2P22307 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCP2P22307 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCP2P22307 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCP2P22307 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCP2P22307 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCP2P22307 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCP2P22307 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCP2P22307 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCP2P22307 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCP2P22307 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCP2P22307 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCP2P22307 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCP2P22307 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCP2P22307 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCP2P22307 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCP2P22307 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCP2P22307 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCP2P22307 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCP2P22307 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCP2P22307 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCP2P22307 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCP2P22307 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCP2P22307 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCP2P22307 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCP2P22307 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCP2P22307 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCP2P22307 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCP2P22307 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCP2P22307 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCP2P22307 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCP2P22307 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCP2P22307 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCP2P22307 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCP2P22307 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCP2P22307 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCP2P22307 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCP2P22307 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SCP2P22307 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCP2P22307 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCP2P22307 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCP2P22307 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCP2P22307 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCP2P22307 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms