Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT1P21579 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT1P21579 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT1P21579 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT1P21579 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT1P21579 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT1P21579 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT1P21579 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT1P21579 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT1P21579 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT1P21579 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYT1P21579 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SYT1P21579 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYT1P21579 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYT1P21579 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYT1P21579 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYT1P21579 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYT1P21579 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYT1P21579 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYT1P21579 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYT1P21579 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SYT1P21579 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYT1P21579 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYT1P21579 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYT1P21579 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYT1P21579 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYT1P21579 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYT1P21579 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SYT1P21579 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYT1P21579 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYT1P21579 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYT1P21579 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYT1P21579 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYT1P21579 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYT1P21579 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYT1P21579 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYT1P21579 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYT1P21579 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYT1P21579 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYT1P21579 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYT1P21579 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYT1P21579 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYT1P21579 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYT1P21579 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYT1P21579 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYT1P21579 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYT1P21579 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SYT1P21579 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYT1P21579 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYT1P21579 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYT1P21579 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYT1P21579 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYT1P21579 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYT1P21579 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYT1P21579 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYT1P21579 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYT1P21579 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYT1P21579 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYT1P21579 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYT1P21579 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYT1P21579 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYT1P21579 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYT1P21579 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYT1P21579 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYT1P21579 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SYT1P21579 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYT1P21579 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SYT1P21579 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYT1P21579 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYT1P21579 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYT1P21579 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT1P21579 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT1P21579 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT1P21579 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT1P21579 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT1P21579 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT1P21579 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT1P21579 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT1P21579 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT1P21579 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT1P21579 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT1P21579 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT1P21579 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT1P21579 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT1P21579 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT1P21579 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT1P21579 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYT1P21579 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYT1P21579 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SYT1P21579 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYT1P21579 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYT1P21579 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYT1P21579 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYT1P21579 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYT1P21579 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYT1P21579 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYT1P21579 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYT1P21579 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT1P21579 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT1P21579 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms