Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCB4P21439 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCB4P21439 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCB4P21439 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCB4P21439 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCB4P21439 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCB4P21439 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCB4P21439 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCB4P21439 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCB4P21439 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCB4P21439 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCB4P21439 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCB4P21439 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCB4P21439 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCB4P21439 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCB4P21439 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms