Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C4BPBP20851 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms