Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms