Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AMY2BP19961 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms