Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TFE3P19532 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TFE3P19532 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TFE3P19532 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TFE3P19532 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TFE3P19532 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TFE3P19532 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TFE3P19532 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TFE3P19532 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TFE3P19532 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TFE3P19532 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TFE3P19532 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TFE3P19532 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TFE3P19532 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TFE3P19532 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TFE3P19532 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TFE3P19532 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TFE3P19532 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TFE3P19532 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TFE3P19532 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFE3P19532 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFE3P19532 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFE3P19532 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFE3P19532 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFE3P19532 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFE3P19532 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFE3P19532 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFE3P19532 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFE3P19532 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFE3P19532 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TFE3P19532 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFE3P19532 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFE3P19532 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFE3P19532 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFE3P19532 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFE3P19532 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFE3P19532 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFE3P19532 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFE3P19532 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFE3P19532 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFE3P19532 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFE3P19532 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFE3P19532 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFE3P19532 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFE3P19532 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFE3P19532 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFE3P19532 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TFE3P19532 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFE3P19532 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFE3P19532 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TFE3P19532 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TFE3P19532 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TFE3P19532 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TFE3P19532 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFE3P19532 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFE3P19532 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFE3P19532 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFE3P19532 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFE3P19532 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFE3P19532 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFE3P19532 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFE3P19532 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFE3P19532 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFE3P19532 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFE3P19532 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFE3P19532 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFE3P19532 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFE3P19532 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFE3P19532 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFE3P19532 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFE3P19532 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFE3P19532 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFE3P19532 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFE3P19532 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFE3P19532 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFE3P19532 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TFE3P19532 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFE3P19532 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFE3P19532 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFE3P19532 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFE3P19532 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFE3P19532 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFE3P19532 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFE3P19532 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFE3P19532 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFE3P19532 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFE3P19532 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TFE3P19532 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFE3P19532 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFE3P19532 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TFE3P19532 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFE3P19532 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFE3P19532 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFE3P19532 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFE3P19532 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFE3P19532 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFE3P19532 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFE3P19532 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFE3P19532 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFE3P19532 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms