Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCLP19338 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCLP19338 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCLP19338 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCLP19338 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCLP19338 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NCLP19338 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCLP19338 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCLP19338 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCLP19338 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCLP19338 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCLP19338 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCLP19338 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCLP19338 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCLP19338 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCLP19338 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCLP19338 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCLP19338 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCLP19338 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCLP19338 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCLP19338 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCLP19338 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCLP19338 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCLP19338 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCLP19338 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCLP19338 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCLP19338 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCLP19338 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCLP19338 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCLP19338 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCLP19338 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NCLP19338 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCLP19338 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCLP19338 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NCLP19338 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCLP19338 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCLP19338 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCLP19338 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCLP19338 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCLP19338 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCLP19338 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCLP19338 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCLP19338 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCLP19338 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCLP19338 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCLP19338 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCLP19338 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCLP19338 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCLP19338 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCLP19338 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCLP19338 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCLP19338 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCLP19338 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCLP19338 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCLP19338 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCLP19338 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCLP19338 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCLP19338 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCLP19338 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCLP19338 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCLP19338 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCLP19338 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCLP19338 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCLP19338 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCLP19338 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCLP19338 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NCLP19338 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCLP19338 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCLP19338 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCLP19338 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCLP19338 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCLP19338 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCLP19338 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NCLP19338 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCLP19338 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCLP19338 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCLP19338 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCLP19338 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCLP19338 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCLP19338 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCLP19338 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCLP19338 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCLP19338 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCLP19338 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCLP19338 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCLP19338 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCLP19338 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCLP19338 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NCLP19338 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NCLP19338 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCLP19338 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCLP19338 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCLP19338 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCLP19338 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NCLP19338 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCLP19338 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCLP19338 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCLP19338 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCLP19338 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCLP19338 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms