Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDCP19113 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDCP19113 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDCP19113 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDCP19113 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDCP19113 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDCP19113 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDCP19113 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDCP19113 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDCP19113 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
HDCP19113 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
HDCP19113 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDCP19113 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDCP19113 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDCP19113 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDCP19113 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDCP19113 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDCP19113 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDCP19113 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDCP19113 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDCP19113 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDCP19113 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDCP19113 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDCP19113 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDCP19113 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDCP19113 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDCP19113 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDCP19113 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDCP19113 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDCP19113 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDCP19113 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDCP19113 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDCP19113 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDCP19113 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDCP19113 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HDCP19113 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDCP19113 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDCP19113 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDCP19113 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDCP19113 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDCP19113 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDCP19113 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDCP19113 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDCP19113 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDCP19113 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDCP19113 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDCP19113 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDCP19113 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDCP19113 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDCP19113 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDCP19113 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDCP19113 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDCP19113 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDCP19113 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDCP19113 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDCP19113 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDCP19113 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HDCP19113 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDCP19113 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDCP19113 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDCP19113 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDCP19113 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDCP19113 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDCP19113 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDCP19113 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDCP19113 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDCP19113 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDCP19113 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDCP19113 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDCP19113 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDCP19113 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDCP19113 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDCP19113 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDCP19113 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDCP19113 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDCP19113 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDCP19113 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDCP19113 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDCP19113 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDCP19113 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HDCP19113 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDCP19113 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDCP19113 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDCP19113 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDCP19113 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDCP19113 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDCP19113 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDCP19113 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDCP19113 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDCP19113 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDCP19113 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDCP19113 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HDCP19113 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDCP19113 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDCP19113 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDCP19113 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDCP19113 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HDCP19113 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDCP19113 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDCP19113 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms