Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPRAP18433 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms