Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCP1P17987 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCP1P17987 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCP1P17987 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCP1P17987 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCP1P17987 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCP1P17987 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCP1P17987 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCP1P17987 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCP1P17987 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCP1P17987 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCP1P17987 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCP1P17987 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TCP1P17987 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCP1P17987 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCP1P17987 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCP1P17987 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCP1P17987 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCP1P17987 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TCP1P17987 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCP1P17987 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCP1P17987 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCP1P17987 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCP1P17987 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCP1P17987 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TCP1P17987 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCP1P17987 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCP1P17987 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCP1P17987 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCP1P17987 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCP1P17987 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCP1P17987 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TCP1P17987 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCP1P17987 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCP1P17987 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCP1P17987 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCP1P17987 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCP1P17987 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCP1P17987 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCP1P17987 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCP1P17987 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCP1P17987 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCP1P17987 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCP1P17987 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCP1P17987 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCP1P17987 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCP1P17987 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCP1P17987 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCP1P17987 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TCP1P17987 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TCP1P17987 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCP1P17987 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCP1P17987 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCP1P17987 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCP1P17987 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCP1P17987 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCP1P17987 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCP1P17987 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCP1P17987 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCP1P17987 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCP1P17987 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCP1P17987 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCP1P17987 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCP1P17987 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCP1P17987 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCP1P17987 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCP1P17987 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCP1P17987 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TCP1P17987 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCP1P17987 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TCP1P17987 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCP1P17987 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCP1P17987 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCP1P17987 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCP1P17987 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCP1P17987 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCP1P17987 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TCP1P17987 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCP1P17987 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCP1P17987 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCP1P17987 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCP1P17987 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCP1P17987 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCP1P17987 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCP1P17987 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCP1P17987 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCP1P17987 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCP1P17987 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCP1P17987 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCP1P17987 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCP1P17987 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCP1P17987 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCP1P17987 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCP1P17987 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCP1P17987 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCP1P17987 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCP1P17987 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCP1P17987 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCP1P17987 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCP1P17987 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms