Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DESP17661 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DESP17661 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DESP17661 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DESP17661 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DESP17661 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DESP17661 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DESP17661 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DESP17661 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DESP17661 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DESP17661 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DESP17661 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DESP17661 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DESP17661 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DESP17661 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DESP17661 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DESP17661 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DESP17661 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DESP17661 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DESP17661 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DESP17661 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DESP17661 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DESP17661 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DESP17661 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DESP17661 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DESP17661 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DESP17661 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DESP17661 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DESP17661 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DESP17661 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DESP17661 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DESP17661 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DESP17661 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DESP17661 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DESP17661 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DESP17661 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DESP17661 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DESP17661 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DESP17661 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DESP17661 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DESP17661 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DESP17661 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DESP17661 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DESP17661 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DESP17661 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DESP17661 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DESP17661 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DESP17661 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DESP17661 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DESP17661 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DESP17661 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DESP17661 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DESP17661 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DESP17661 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DESP17661 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DESP17661 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DESP17661 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DESP17661 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DESP17661 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DESP17661 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DESP17661 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DESP17661 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DESP17661 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DESP17661 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DESP17661 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DESP17661 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DESP17661 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DESP17661 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DESP17661 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DESP17661 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DESP17661 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DESP17661 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DESP17661 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DESP17661 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DESP17661 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DESP17661 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DESP17661 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DESP17661 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DESP17661 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DESP17661 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DESP17661 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DESP17661 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DESP17661 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DESP17661 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DESP17661 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DESP17661 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DESP17661 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DESP17661 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DESP17661 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DESP17661 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DESP17661 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DESP17661 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DESP17661 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DESP17661 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DESP17661 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DESP17661 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DESP17661 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DESP17661 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DESP17661 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DESP17661 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms