Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF7P17544 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF7P17544 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF7P17544 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF7P17544 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF7P17544 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF7P17544 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF7P17544 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF7P17544 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF7P17544 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF7P17544 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF7P17544 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF7P17544 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF7P17544 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF7P17544 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF7P17544 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF7P17544 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF7P17544 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF7P17544 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF7P17544 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF7P17544 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF7P17544 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF7P17544 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF7P17544 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF7P17544 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF7P17544 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF7P17544 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF7P17544 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF7P17544 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF7P17544 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF7P17544 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF7P17544 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF7P17544 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF7P17544 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF7P17544 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF7P17544 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF7P17544 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF7P17544 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF7P17544 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF7P17544 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF7P17544 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF7P17544 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF7P17544 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF7P17544 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF7P17544 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF7P17544 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF7P17544 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF7P17544 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF7P17544 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF7P17544 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF7P17544 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF7P17544 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF7P17544 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF7P17544 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF7P17544 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF7P17544 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF7P17544 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF7P17544 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF7P17544 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF7P17544 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF7P17544 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF7P17544 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF7P17544 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF7P17544 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF7P17544 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF7P17544 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF7P17544 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF7P17544 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATF7P17544 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF7P17544 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF7P17544 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF7P17544 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF7P17544 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF7P17544 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF7P17544 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF7P17544 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF7P17544 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF7P17544 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF7P17544 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF7P17544 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF7P17544 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF7P17544 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF7P17544 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF7P17544 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF7P17544 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF7P17544 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF7P17544 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF7P17544 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF7P17544 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF7P17544 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF7P17544 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF7P17544 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF7P17544 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF7P17544 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF7P17544 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF7P17544 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF7P17544 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF7P17544 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF7P17544 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF7P17544 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms