Protein–RNA interactions for Protein: P16118

PFKFB1, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB1P16118 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PFKFB1P16118 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PFKFB1P16118 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PFKFB1P16118 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PFKFB1P16118 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PFKFB1P16118 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PFKFB1P16118 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PFKFB1P16118 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PFKFB1P16118 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PFKFB1P16118 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PFKFB1P16118 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PFKFB1P16118 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PFKFB1P16118 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PFKFB1P16118 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PFKFB1P16118 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PFKFB1P16118 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PFKFB1P16118 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PFKFB1P16118 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PFKFB1P16118 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PFKFB1P16118 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PFKFB1P16118 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PFKFB1P16118 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PFKFB1P16118 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PFKFB1P16118 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PFKFB1P16118 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PFKFB1P16118 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PFKFB1P16118 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PFKFB1P16118 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PFKFB1P16118 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PFKFB1P16118 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PFKFB1P16118 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PFKFB1P16118 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PFKFB1P16118 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PFKFB1P16118 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PFKFB1P16118 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PFKFB1P16118 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PFKFB1P16118 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PFKFB1P16118 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PFKFB1P16118 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms