Protein–RNA interactions for Protein: P15170

GSPT1, Eukaryotic peptide chain release factor GTP-binding subunit ERF3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSPT1P15170 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GSPT1P15170 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSPT1P15170 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSPT1P15170 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSPT1P15170 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSPT1P15170 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GSPT1P15170 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSPT1P15170 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSPT1P15170 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSPT1P15170 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSPT1P15170 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSPT1P15170 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GSPT1P15170 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSPT1P15170 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSPT1P15170 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GSPT1P15170 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GSPT1P15170 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GSPT1P15170 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GSPT1P15170 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GSPT1P15170 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GSPT1P15170 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSPT1P15170 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GSPT1P15170 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSPT1P15170 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSPT1P15170 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSPT1P15170 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GSPT1P15170 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GSPT1P15170 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GSPT1P15170 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GSPT1P15170 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GSPT1P15170 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms