Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms