Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TNNT1P13805 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms