Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARGP13631 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARGP13631 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARGP13631 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARGP13631 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARGP13631 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARGP13631 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RARGP13631 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARGP13631 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARGP13631 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARGP13631 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARGP13631 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARGP13631 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARGP13631 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARGP13631 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARGP13631 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARGP13631 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARGP13631 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARGP13631 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARGP13631 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARGP13631 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARGP13631 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARGP13631 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARGP13631 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARGP13631 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARGP13631 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARGP13631 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RARGP13631 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARGP13631 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARGP13631 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARGP13631 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARGP13631 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARGP13631 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARGP13631 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARGP13631 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARGP13631 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARGP13631 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARGP13631 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARGP13631 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARGP13631 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARGP13631 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARGP13631 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARGP13631 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARGP13631 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARGP13631 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARGP13631 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARGP13631 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARGP13631 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARGP13631 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARGP13631 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARGP13631 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARGP13631 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARGP13631 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARGP13631 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARGP13631 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARGP13631 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARGP13631 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARGP13631 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARGP13631 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARGP13631 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARGP13631 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARGP13631 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARGP13631 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARGP13631 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARGP13631 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RARGP13631 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RARGP13631 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARGP13631 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARGP13631 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARGP13631 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARGP13631 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARGP13631 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARGP13631 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARGP13631 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARGP13631 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARGP13631 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARGP13631 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARGP13631 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARGP13631 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARGP13631 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARGP13631 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARGP13631 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARGP13631 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARGP13631 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARGP13631 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARGP13631 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARGP13631 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARGP13631 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARGP13631 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARGP13631 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARGP13631 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARGP13631 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RARGP13631 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RARGP13631 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARGP13631 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RARGP13631 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARGP13631 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARGP13631 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARGP13631 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARGP13631 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms