Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms