Protein–RNA interactions for Protein: P11171

EPB41, Protein 4.1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41P11171 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41P11171 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41P11171 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41P11171 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPB41P11171 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPB41P11171 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPB41P11171 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPB41P11171 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPB41P11171 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPB41P11171 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPB41P11171 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPB41P11171 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPB41P11171 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPB41P11171 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPB41P11171 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPB41P11171 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPB41P11171 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPB41P11171 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPB41P11171 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EPB41P11171 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPB41P11171 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPB41P11171 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPB41P11171 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPB41P11171 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPB41P11171 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPB41P11171 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPB41P11171 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPB41P11171 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPB41P11171 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPB41P11171 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPB41P11171 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPB41P11171 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPB41P11171 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPB41P11171 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPB41P11171 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPB41P11171 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPB41P11171 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPB41P11171 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPB41P11171 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPB41P11171 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPB41P11171 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPB41P11171 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPB41P11171 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPB41P11171 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPB41P11171 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPB41P11171 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPB41P11171 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPB41P11171 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPB41P11171 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPB41P11171 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPB41P11171 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPB41P11171 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EPB41P11171 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPB41P11171 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPB41P11171 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPB41P11171 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPB41P11171 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPB41P11171 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EPB41P11171 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EPB41P11171 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPB41P11171 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPB41P11171 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPB41P11171 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPB41P11171 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPB41P11171 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPB41P11171 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPB41P11171 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPB41P11171 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPB41P11171 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPB41P11171 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPB41P11171 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPB41P11171 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPB41P11171 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPB41P11171 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPB41P11171 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPB41P11171 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPB41P11171 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPB41P11171 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPB41P11171 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPB41P11171 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPB41P11171 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPB41P11171 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPB41P11171 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPB41P11171 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPB41P11171 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPB41P11171 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPB41P11171 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPB41P11171 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPB41P11171 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPB41P11171 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPB41P11171 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPB41P11171 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPB41P11171 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPB41P11171 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EPB41P11171 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPB41P11171 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPB41P11171 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPB41P11171 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPB41P11171 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPB41P11171 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms