Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms