Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms