Protein–RNA interactions for Protein: P0C2S0

CTXN2, Cortexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN2P0C2S0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN2P0C2S0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms