Protein–RNA interactions for Protein: P09661

SNRPA1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPA1P09661 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNRPA1P09661 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNRPA1P09661 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNRPA1P09661 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNRPA1P09661 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNRPA1P09661 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNRPA1P09661 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNRPA1P09661 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNRPA1P09661 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNRPA1P09661 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNRPA1P09661 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNRPA1P09661 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms