Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOP08100 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOP08100 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOP08100 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOP08100 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOP08100 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOP08100 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOP08100 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOP08100 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOP08100 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOP08100 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOP08100 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOP08100 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOP08100 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOP08100 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOP08100 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOP08100 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOP08100 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOP08100 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RHOP08100 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RHOP08100 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHOP08100 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RHOP08100 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHOP08100 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHOP08100 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RHOP08100 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHOP08100 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOP08100 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOP08100 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOP08100 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOP08100 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOP08100 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOP08100 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOP08100 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOP08100 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOP08100 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOP08100 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOP08100 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOP08100 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOP08100 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOP08100 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOP08100 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOP08100 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOP08100 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOP08100 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOP08100 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOP08100 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOP08100 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOP08100 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOP08100 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOP08100 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOP08100 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOP08100 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOP08100 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOP08100 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOP08100 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOP08100 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOP08100 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOP08100 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOP08100 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOP08100 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOP08100 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOP08100 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOP08100 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOP08100 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOP08100 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOP08100 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOP08100 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOP08100 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOP08100 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOP08100 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOP08100 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOP08100 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOP08100 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOP08100 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOP08100 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOP08100 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOP08100 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOP08100 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOP08100 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOP08100 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOP08100 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOP08100 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOP08100 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOP08100 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOP08100 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOP08100 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOP08100 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOP08100 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOP08100 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOP08100 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOP08100 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOP08100 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOP08100 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOP08100 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOP08100 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOP08100 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOP08100 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOP08100 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOP08100 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms