Protein–RNA interactions for Protein: P04843

RPN1, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN1P04843 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPN1P04843 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPN1P04843 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPN1P04843 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPN1P04843 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPN1P04843 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPN1P04843 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPN1P04843 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPN1P04843 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPN1P04843 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPN1P04843 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPN1P04843 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPN1P04843 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RPN1P04843 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPN1P04843 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPN1P04843 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPN1P04843 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPN1P04843 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPN1P04843 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPN1P04843 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RPN1P04843 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPN1P04843 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPN1P04843 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPN1P04843 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RPN1P04843 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPN1P04843 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPN1P04843 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPN1P04843 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPN1P04843 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPN1P04843 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPN1P04843 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPN1P04843 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPN1P04843 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPN1P04843 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPN1P04843 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPN1P04843 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPN1P04843 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPN1P04843 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPN1P04843 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPN1P04843 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPN1P04843 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPN1P04843 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPN1P04843 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPN1P04843 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPN1P04843 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPN1P04843 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPN1P04843 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RPN1P04843 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPN1P04843 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPN1P04843 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPN1P04843 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPN1P04843 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPN1P04843 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPN1P04843 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPN1P04843 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPN1P04843 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPN1P04843 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPN1P04843 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPN1P04843 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPN1P04843 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPN1P04843 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPN1P04843 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPN1P04843 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RPN1P04843 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPN1P04843 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPN1P04843 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPN1P04843 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPN1P04843 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPN1P04843 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPN1P04843 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPN1P04843 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPN1P04843 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPN1P04843 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPN1P04843 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPN1P04843 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPN1P04843 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPN1P04843 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPN1P04843 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPN1P04843 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RPN1P04843 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPN1P04843 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RPN1P04843 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RPN1P04843 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPN1P04843 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPN1P04843 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPN1P04843 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
RPN1P04843 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
RPN1P04843 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPN1P04843 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
RPN1P04843 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPN1P04843 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPN1P04843 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPN1P04843 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPN1P04843 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPN1P04843 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPN1P04843 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPN1P04843 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPN1P04843 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RPN1P04843 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPN1P04843 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms