Protein–RNA interactions for Protein: P01903

HLA-DRA, HLA class II histocompatibility antigen, DR alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRAP01903 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DRAP01903 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HLA-DRAP01903 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HLA-DRAP01903 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HLA-DRAP01903 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HLA-DRAP01903 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HLA-DRAP01903 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HLA-DRAP01903 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms