Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYF2O95926 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYF2O95926 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYF2O95926 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYF2O95926 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYF2O95926 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SYF2O95926 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYF2O95926 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYF2O95926 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYF2O95926 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYF2O95926 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYF2O95926 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYF2O95926 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYF2O95926 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYF2O95926 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYF2O95926 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYF2O95926 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYF2O95926 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYF2O95926 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYF2O95926 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYF2O95926 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYF2O95926 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYF2O95926 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYF2O95926 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYF2O95926 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYF2O95926 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYF2O95926 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYF2O95926 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYF2O95926 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYF2O95926 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYF2O95926 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYF2O95926 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYF2O95926 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYF2O95926 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYF2O95926 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYF2O95926 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYF2O95926 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYF2O95926 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYF2O95926 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYF2O95926 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYF2O95926 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYF2O95926 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYF2O95926 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYF2O95926 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYF2O95926 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYF2O95926 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYF2O95926 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYF2O95926 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYF2O95926 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYF2O95926 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYF2O95926 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYF2O95926 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYF2O95926 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYF2O95926 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYF2O95926 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SYF2O95926 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYF2O95926 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYF2O95926 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYF2O95926 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYF2O95926 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYF2O95926 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYF2O95926 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYF2O95926 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SYF2O95926 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYF2O95926 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYF2O95926 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYF2O95926 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYF2O95926 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYF2O95926 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYF2O95926 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYF2O95926 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYF2O95926 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYF2O95926 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYF2O95926 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYF2O95926 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYF2O95926 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYF2O95926 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYF2O95926 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYF2O95926 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SYF2O95926 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYF2O95926 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SYF2O95926 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYF2O95926 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SYF2O95926 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYF2O95926 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SYF2O95926 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SYF2O95926 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYF2O95926 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYF2O95926 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYF2O95926 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SYF2O95926 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYF2O95926 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYF2O95926 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYF2O95926 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYF2O95926 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYF2O95926 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYF2O95926 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYF2O95926 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYF2O95926 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYF2O95926 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms