Protein–RNA interactions for Protein: O95749

GGPS1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1O95749 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGPS1O95749 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms