Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ABCB11O95342 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ABCB11O95342 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ABCB11O95342 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ABCB11O95342 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ABCB11O95342 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ABCB11O95342 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ABCB11O95342 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ABCB11O95342 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ABCB11O95342 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ABCB11O95342 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ABCB11O95342 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCB11O95342 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ABCB11O95342 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ABCB11O95342 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ABCB11O95342 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ABCB11O95342 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ABCB11O95342 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
ABCB11O95342 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
ABCB11O95342 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ABCB11O95342 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
ABCB11O95342 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ABCB11O95342 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCB11O95342 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCB11O95342 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCB11O95342 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms