Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIF4AO95239 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms