Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKL5O76039 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms