Protein–RNA interactions for Protein: O76011

KRT34, Keratin, type I cuticular Ha4, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT34O76011 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT34O76011 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT34O76011 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT34O76011 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT34O76011 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT34O76011 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT34O76011 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT34O76011 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT34O76011 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT34O76011 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT34O76011 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT34O76011 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT34O76011 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT34O76011 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT34O76011 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT34O76011 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT34O76011 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT34O76011 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT34O76011 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT34O76011 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT34O76011 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT34O76011 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT34O76011 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT34O76011 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT34O76011 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT34O76011 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT34O76011 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT34O76011 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT34O76011 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT34O76011 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT34O76011 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT34O76011 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT34O76011 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT34O76011 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT34O76011 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT34O76011 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT34O76011 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT34O76011 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT34O76011 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT34O76011 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT34O76011 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT34O76011 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT34O76011 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT34O76011 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT34O76011 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT34O76011 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT34O76011 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT34O76011 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT34O76011 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT34O76011 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT34O76011 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT34O76011 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT34O76011 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT34O76011 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT34O76011 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT34O76011 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT34O76011 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT34O76011 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT34O76011 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT34O76011 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT34O76011 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT34O76011 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT34O76011 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT34O76011 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT34O76011 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT34O76011 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT34O76011 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT34O76011 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT34O76011 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT34O76011 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT34O76011 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT34O76011 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT34O76011 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT34O76011 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT34O76011 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT34O76011 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT34O76011 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT34O76011 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT34O76011 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT34O76011 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT34O76011 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT34O76011 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT34O76011 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT34O76011 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT34O76011 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT34O76011 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT34O76011 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT34O76011 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT34O76011 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT34O76011 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT34O76011 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRT34O76011 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRT34O76011 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRT34O76011 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRT34O76011 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRT34O76011 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT34O76011 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT34O76011 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT34O76011 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT34O76011 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms