Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCATO75600 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCATO75600 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCATO75600 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GCATO75600 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCATO75600 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCATO75600 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCATO75600 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCATO75600 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCATO75600 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GCATO75600 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCATO75600 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GCATO75600 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCATO75600 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCATO75600 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCATO75600 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCATO75600 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCATO75600 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCATO75600 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCATO75600 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCATO75600 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCATO75600 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCATO75600 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCATO75600 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCATO75600 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCATO75600 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCATO75600 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCATO75600 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCATO75600 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCATO75600 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCATO75600 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCATO75600 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCATO75600 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCATO75600 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCATO75600 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCATO75600 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCATO75600 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GCATO75600 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GCATO75600 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GCATO75600 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GCATO75600 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GCATO75600 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GCATO75600 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GCATO75600 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GCATO75600 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
GCATO75600 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GCATO75600 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GCATO75600 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GCATO75600 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
GCATO75600 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GCATO75600 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GCATO75600 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GCATO75600 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GCATO75600 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCATO75600 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCATO75600 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GCATO75600 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCATO75600 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GCATO75600 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GCATO75600 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCATO75600 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCATO75600 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCATO75600 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCATO75600 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GCATO75600 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GCATO75600 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GCATO75600 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GCATO75600 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCATO75600 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
GCATO75600 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GCATO75600 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GCATO75600 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCATO75600 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCATO75600 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GCATO75600 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GCATO75600 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GCATO75600 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCATO75600 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCATO75600 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
GCATO75600 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCATO75600 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCATO75600 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCATO75600 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCATO75600 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCATO75600 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GCATO75600 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GCATO75600 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCATO75600 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GCATO75600 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GCATO75600 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCATO75600 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GCATO75600 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GCATO75600 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GCATO75600 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GCATO75600 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GCATO75600 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GCATO75600 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCATO75600 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCATO75600 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
GCATO75600 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms